De Universiteit van Fribourg werd in 1889 zowel als staats-universiteit als katholieke universiteit opgericht. Haar internationale karakter weerspiegelt de situatie van Fribourg, gelegen op de grens van de Franse en de Duitse cultuur.
Aan de twee faculteiten Rechten en Letterkunde die in het begin werden geopend, werd in 1890 een theologische faculteit en in 1896 een faculteit Exacte Wetenschappen toegevoegd. De zorg voor de theologische faculteit werd aan de Dominicanen toevertrouwd, in een klimaat van intellectuele vernieuwing en van terugkeer naar sint Thomas van Aquino, gestimuleerd door paus Leo XIII.